MetaboNet：Type1糖尿病管理のための最大の公開統合データセット

arXiv:2601.11505v2 発表タイプ：置換 要約：Type1糖尿病（T1D）アルゴリズム開発の進展は、既存のT1D管理データセットの断片化および標準化の欠如に制限されている。現在のデータセットは構造に大きな差異があり、アクセスおよび処理に時間がかかります。これにより、データ統合が阻害され、アルゴリズム開発の可比性及び汎用性が低下しています。本研究は、T1Dアルゴリズム開発のための統合的かつアクセスしやすいデータリソース確立を目指します。複数の公開T1Dデータセットを統合し、これをMetaboNetデータセットと呼んでいます。その条件は、連続型血糖監視（CGM）データおよび対応するインスリンポンプ投与記録の両方の可用性でした。また、報告炭水化物摂取量や身体的活動などの補助情報が存在する場合、それらも保持されました。MetaboNetデータセットは、3,135人の被験者と1,228人の患者年分の重複CGMおよびインスリンデータを有しており、既存の独立したベンチマークデータセットに比べて著しく巨大です。このリソースは、https://metabo-net.org/ で即時ダウンロード可能な完全な公開サブセット、および個別の申請プロセスを通じてアクセス可能なデータ使用合意（DUA）に制限されたサブセットとして配布されています。後者のサブセットについては、データを標準化されたMetaboNet形式に変換するために自動的に処理パイプラインが提供されています。本研究では、T1D研究のための統合公開データセットが提示され、その制限付きおよびDUAによる両方のコンポーネントへのアクセス経路が説明されています。結果として得られたデータセットは、幅広いグリセミックプロファイルおよびデモグラフィックスをカバーしており、個々のデータセットよりも汎用性の高いアルゴリズム性能を提供できます。

arXiv:2601.11505v2 Announce Type: replace Abstract: Progress in Type 1 Diabetes (T1D) algorithm development is limited by the fragmentation and lack of standardization across existing T1D management datasets. Current datasets differ substantially in structure and are time-consuming to access and process, which impedes data integration and reduces the comparability and generalizability of algorithmic developments. This work aims to establish a unified and accessible data resource for T1D algorithm development. Multiple publicly available T1D datasets were consolidated into a unified resource, termed the MetaboNet dataset. Inclusion required the availability of both continuous glucose monitoring (CGM) data and corresponding insulin pump dosing records. Additionally, auxiliary information such as reported carbohydrate intake and physical activity was retained when present. The MetaboNet dataset comprises 3135 subjects and 1228 patient-years of overlapping CGM and insulin data, making it substantially larger than existing standalone benchmark datasets. The resource is distributed as a fully public subset available for immediate download at https://metabo-net.org/ , and with a Data Use Agreement (DUA)-restricted subset accessible through their respective application processes. For the datasets in the latter subset, processing pipelines are provided to automatically convert the data into the standardized MetaboNet format. A consolidated public dataset for T1D research is presented, and the access pathways for both its unrestricted and DUA-governed components are described. The resulting dataset covers a broad range of glycemic profiles and demographics and thus can yield more generalizable algorithmic performance than individual datasets.